安全性方面，零跑C16采用环状笼式一体车身：四条环状路径结构、9横3纵梁地板、CTC2.0电池底盘一体式骨架结构设计及全框式副车架，达到同级领先的38396N·m/°扭转刚度。75%高强度钢铝混合车身，A、B柱、车顶边梁、门板加强筋等多处关键受力部位采用最高强度达2000Mpa的核潜艇级热成型钢，占比高达16%。
后地板采用1500Mpa热成型钢环状一体加强梁，使得后排地板更坚固，不惧追尾。三排座椅靠背采用钢板强化设计，参照豪车标准，防止三排受到侵入伤害。
同时全车标配6安全气囊，并采用横贯式侧气帘，单个气帘体积高达46.5L充气长度23337mm，覆盖面积9200平方厘米，充分保障1到3排乘客头部安全，正面主驾气囊60L，副驾气囊105L，领先同级20%。
对于电池安全，零跑C16采用电驱AI云诊断+AI BMS大数据智能电池管理系统+集成式热管理系统电池包，实现24小时电芯级的实时监测，热失控预警率100%，通过“热失控预警、热源阻断、定向泄压、智能冷却”等技术有效抑制电池包内部热扩散，极端情况下720min不起火不爆炸，确保电池安全。
辅助驾驶方面，智驾版的零跑C16拥有激光雷达+英伟达Orin-X芯片的组合，搭配800万像素高清摄像头等在内的30枚高性能感知硬件为车辆提供了精确的三维感知、配合自研算法及控制策略，整车算力284TOPS，高速和城市快速路可使用智能领航NAP实现全场景覆盖，城区则可使用NAC导航辅助巡航，解放双脚。