内饰方面，EQC车内采用奔驰家族的全新设计，环抱式座舱营造了更加豪华的驾乘氛围，中控台造型舒展，仪表盘与中控多媒体之间的双联屏样式，属于奔驰车型的标志性特征之一。中控台表面采用大面积带有缝线效果的皮革材质，前后门板同样大部分区域由包括皮革、软塑混拼材质包裹，甚至连储物区域都使用了软性材质，搭配其它细节处的黑色烤漆、木纹饰板、以及镀铬边框等元素点缀，在整体做工和质感方面，体现了奔驰车型对于高端优雅的一贯追求。全系共提供了四种内饰风格，除了黑色/蓝色双拼样式略显小众，其它三种均为常规样式，黑色与黑色/米黄色双拼内饰，在细节处可选装开孔型黑色岑木木饰板和棕色岑木木饰板，价格为2800元。
三辐式多功能方向盘与奔驰燃油车型上的保持一致，两侧集成了黑色快捷键的按键区，负责行车电脑、蓝牙语音、定速巡航、多媒体调节等辅助功能，握柄处采用真皮包裹，后方配有换挡拨片，EQC350 4MATIC方向盘支持手动四向调节，EQC400 4MATIC升级为电动四向调节，且配备了方向盘记忆功能。
全系标配10.25英寸全液晶仪表盘，界面风格与燃油版车型基本一致，显示效果清晰细腻，内容方面根据电动车属性有所调整，支持全屏导航等丰富的信息；全系均可选装HUD抬头显示系统，价格为9000元，标配了前排手机无线充电模块。