内饰方面，相较法拉利488 GT3，法拉利296 GT3的座舱焕然一新。众多控制和功能按键均已移至灵感源自F1单座赛车的全新方向盘上。同时，Sabelt座椅位置无论在白天还是夜晚均可确保清晰视野。法拉利296 GT3的座舱为不同体型和身高的车手带来全新升级的舒适体验，车手可通过可调节踏板和方向盘找到属于自己的舒适坐姿。空调系统和座舱内的气流可在任何环境中提供充足的通风。
法拉利296 GT3的推出，预示着6缸发动机的法拉利赛车将重返赛道。不过，为了遵守技术规则，新车未配备296 GTB所搭载的电机单元。但法拉利296 GTB公路跑车的120° V型设计、相等点火间距以及布局在V型结构内部的涡轮增压器等配置，均被引入了新车的V6内燃机。作为法拉利设计的核心，发动机在这台赛车上的位置相较公路跑车的更靠前且更低，相较法拉利488 GT3，新车的抗扭刚度提升了约10%。
由于取消了外部集气箱和外部支架，发动机变得更轻、更紧凑。因体积的减小，缸内流体动力学表现进一步优化，提升了进气效率。 法拉利对发动机缸内流体动力学以及为赛道版动力系统开发的特定部件进行了调校，以确保赛车在“冲刺”和“耐力”比赛中的性能、可靠性和驾驶操控性。