车内的话，远航Y6搭载了阿里斑马AliOS智能座舱系统，内置高通骁龙第三代SA8155P车规级芯片，并拥有17.38英寸中控娱乐屏、70英寸AR-HUD增强现实抬头显示系统、人脸识别无感进入系统、NFC钥匙等智能科技配置。
此外，新车还配备了包括主副驾音乐头枕+天空扬声器在内的全车27个扬声器，支持独立功放和Wanos全景声音效，打造出沉浸式光感音乐舱。256色环绕氛围灯可实现驾驶模式、呼吸模式、流水迎宾模式和音乐律动模式等动态氛围的效果切换，兼顾豪华感与科技感。
远航Y6第二排座椅可实现最大145°的靠背角度，配合有效隔绝99.9％的紫外线和红外线的穹顶式智能调光镀银天幕，保证车内通透性和乘坐舒适性。
在智能驾驶方面，新车拥有高级智驾系统，包括TJA交通拥堵辅助、HWA高速巡航辅助、ALC转向灯控制变道、LCK车道居中保持、FSRA全速自适应巡航系统、RCTB后方横穿制动、AEB自动紧急制动等基础辅助能力。此外，通过华为智能车控VDC 2.0、华为双冗余智能转向系统，从而实现DMS疲劳驾驶监测、方向盘离手检测安全提示、APA全自动泊车、RPA遥控泊车等功能。