内饰设计方面，CX-50内饰造型与海外版车型基本保持一致，车内采用了简洁的设计风格，配备了悬浮式中控屏幕以及液晶+机械式的仪表组合，车辆的空调出风口等部分均采用较为硬朗的方形设计，与外观设计形成了呼应。
内饰材料的选择上，CX-50皮革座椅的中心材料采用高光泽、触感极具优良的cordovan调和皮材质作为点缀贯穿，搭配粗犷而不失精致的“X”CROSS对称缝线装饰，增加SUV的越野气息，同时在座椅侧面交界区域运用降落伞材质，打造个性独特的座椅绲边饰条。
不仅如此，中控显示屏采用了可触摸屏，但是中控台的机械开关依然保留。车机系统集成了第三代马自达悦联系统，支持OTA空中升级。此外，国产车型悦联系统实施了专属升级，首次采用了安卓系统和多窗口界面的操作模式，同时支持指令开关和触屏操作，迎合国内用户的使用习惯和喜好。
