是的，外地货车进入北京市区需要办理进京证。根据北京市交通委员会的规定，外埠车辆进入北京市区，需要在各进京检查站或办证处，向工作人员提交相关证件和填写相关表格，办理进京证后，方可进入。未办理进京证的货车，一经发现将处以100元罚款并扣3分的处罚。