根据杭州市区道路限行规定，以下是对违反限行规定的车辆的处理方式： 1. 罚款100元：对于首次违反限行规定的驾驶员，将处以100元的罚款。 2. 扣3分：违反限行规定的驾驶员还将被扣除3分的驾驶分。 3. 限制驶入：在限行时间内，违反限行规定的车辆将被限制进入相应的限行区域。 请注意遵守当地的交通法规和限行政策，以免因违规而受到处罚。