是的，北京对摩托车也有限制。根据北京市政府的规定，摩托车需要在指定的区域行驶，并且需要遵守一定的规定和限制。例如，摩托车不能在五环路以内（含五环路）的主干道、长安街、天安门周边等地区行驶。此外，摩托车也需要按照北京市的机动车尾号限行措施进行限行。具体的限行规定可以查询北京市交通管理局官方网站或者咨询当地交通管理部门。