车船税可以在多个应用程序中缴纳，例如国家税务总局官方发布的“电子税务局”应用，或者一些地区的税务局官方APP，如上海税务APP等。此外，还可以在网上银行或第三方支付平台（如支付宝、微信支付等）进行缴纳。具体可在当地税务局官网或相关部门咨询了解。