一汽轿车马自达和长安马自达的主要区别在于它们所属的母公司不同。一汽轿车马自达隶属于中国第一汽车集团公司，而长安马自达则由中国长安汽车集团股份有限公司与日本马自达汽车公司共同出资成立。这两家公司分别在一汽集团和长安汽车的旗下，因此它们的产品线和品牌定位可能会有所不同。此外，两家公司在市场策略、销售渠道和服务方面也可能有所差异。总的来说，一汽轿车马自达和长安马自达都是马自达在中国的合作伙伴，它们共同推动着马自达品牌在中国市场的发展。