尽管大众ID.3的车身长度相对较短，但其长达2765mm的轴距使车内空间十分宽敞。座椅采用织物和皮质材料包裹，填充物厚实，为乘坐提供了出色的舒适体验。配置上，新车配备了全景天幕、前排座椅加热、30色车内氛围灯、语音控制、倒车影像和疲劳驾驶提示等功能。
2023款ID.3全系新增了IQ.灯光精灵、IQ.语音精灵和IQ.智慧车联系统。从配置角度来看，入门款的纯净智享版新增了内后视镜USB充电口和前排座椅靠背手机袋等功能。
关于配置的差异，2023款ID.3的纯净智享版和极智版可简单理解为“低配版”和“高配版”。极智版相对于纯净智享版增加了多项配置，包括镀光前脸、20英寸轮辋、迎宾照地灯、前排座椅加热、后排中央扶手、30色氛围灯、变道辅助、IQ.Light全LED矩阵大灯和乐享极致包等。这两款车型的官方指导价相差3.54万元。