是的，新车在行驶了1000公里后是可以跑高速的。通常情况下，新车在磨合期内都可以适当跑高速，但需要注意控制车速和转速，避免过高的车速和过激的驾驶行为对车辆造成过大的负荷和磨损。在高速上行驶时，建议保持稳定的行驶速度，遵守交通规则，确保安全驾驶。